MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 44337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013740	CTT	2	6	209912	209917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047562
4002	NC_013740	G	6	6	209928	209933	0 %	0 %	100 %	0 %	284047562
4003	NC_013740	ATG	2	6	209936	209941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047562
4004	NC_013740	GAT	2	6	209956	209961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047562
4005	NC_013740	GCC	2	6	209995	210000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047562
4006	NC_013740	TCC	2	6	210074	210079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047562
4007	NC_013740	G	6	6	210113	210118	0 %	0 %	100 %	0 %	284047562
4008	NC_013740	CCA	2	6	210134	210139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047562
4009	NC_013740	TCC	2	6	210154	210159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047562
4010	NC_013740	GGC	2	6	210183	210188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047562
4011	NC_013740	GTG	2	6	210220	210225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047562
4012	NC_013740	CCA	2	6	210269	210274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047562
4013	NC_013740	AAG	2	6	210314	210319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047562
4014	NC_013740	GGTG	2	8	210330	210337	0 %	25 %	75 %	0 %	284047562
4015	NC_013740	CAG	2	6	210417	210422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047562
4016	NC_013740	GCCG	2	8	210436	210443	0 %	0 %	50 %	50 %	284047562
4017	NC_013740	GGC	2	6	210447	210452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047562
4018	NC_013740	TCA	2	6	210476	210481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047562
4019	NC_013740	GAA	2	6	210525	210530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047562
4020	NC_013740	ATTC	2	8	210594	210601	25 %	50 %	0 %	25 %	284047562
4021	NC_013740	T	7	7	210672	210678	0 %	100 %	0 %	0 %	284047563
4022	NC_013740	CCA	2	6	210757	210762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047563
4023	NC_013740	T	6	6	210800	210805	0 %	100 %	0 %	0 %	284047563
4024	NC_013740	TTC	3	9	210809	210817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047563
4025	NC_013740	CA	3	6	210839	210844	50 %	0 %	0 %	50 %	284047563
4026	NC_013740	AGG	2	6	210894	210899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047563
4027	NC_013740	GGCA	2	8	210970	210977	25 %	0 %	50 %	25 %	284047563
4028	NC_013740	CAG	2	6	210992	210997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
4029	NC_013740	CTT	2	6	211009	211014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047563
4030	NC_013740	T	7	7	211019	211025	0 %	100 %	0 %	0 %	284047563
4031	NC_013740	ACT	2	6	211038	211043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047563
4032	NC_013740	TGC	2	6	211108	211113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047563
4033	NC_013740	CTT	2	6	211156	211161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047563
4034	NC_013740	CCCT	2	8	211211	211218	0 %	25 %	0 %	75 %	284047563
4035	NC_013740	CTG	2	6	211292	211297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047563
4036	NC_013740	CAG	2	6	211388	211393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
4037	NC_013740	CAG	2	6	211442	211447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
4038	NC_013740	CGG	2	6	211471	211476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047563
4039	NC_013740	CCA	2	6	211477	211482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047563
4040	NC_013740	CAT	2	6	211502	211507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047563
4041	NC_013740	TGG	2	6	211533	211538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047563
4042	NC_013740	CGG	2	6	211597	211602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047563
4043	NC_013740	TAA	2	6	211635	211640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284047563
4044	NC_013740	GGT	2	6	211715	211720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047563
4045	NC_013740	ACC	2	6	211743	211748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047563
4046	NC_013740	GCA	2	6	211752	211757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
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4049	NC_013740	GGCT	2	8	211798	211805	0 %	25 %	50 %	25 %	284047563
4050	NC_013740	GCA	2	6	211861	211866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
4051	NC_013740	GAA	2	6	212290	212295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047564
4052	NC_013740	TACGG	2	10	212320	212329	20 %	20 %	40 %	20 %	284047564
4053	NC_013740	GGAAGC	2	12	212353	212364	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	284047564
4054	NC_013740	GGC	2	6	212389	212394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047564
4055	NC_013740	TGG	2	6	212445	212450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047564
4056	NC_013740	GGC	2	6	212479	212484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047564
4057	NC_013740	TAT	2	6	212521	212526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047564
4058	NC_013740	GAA	2	6	212527	212532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047564
4059	NC_013740	CT	3	6	212570	212575	0 %	50 %	0 %	50 %	284047565
4060	NC_013740	AGAA	2	8	212762	212769	75 %	0 %	25 %	0 %	284047565
4061	NC_013740	ACC	2	6	212836	212841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047565
4062	NC_013740	GCG	2	6	212872	212877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
4063	NC_013740	CTGG	2	8	212910	212917	0 %	25 %	50 %	25 %	284047565
4064	NC_013740	ACC	2	6	212956	212961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047565
4065	NC_013740	CCT	2	6	213024	213029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047565
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4067	NC_013740	AGTGA	2	10	213103	213112	40 %	20 %	40 %	0 %	284047565
4068	NC_013740	CTG	2	6	213118	213123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047565
4069	NC_013740	TGC	2	6	213149	213154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047565
4070	NC_013740	GGC	2	6	213171	213176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
4071	NC_013740	GGAA	2	8	213185	213192	50 %	0 %	50 %	0 %	284047565
4072	NC_013740	GGA	2	6	213207	213212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047565
4073	NC_013740	AGG	2	6	213239	213244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047565
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4075	NC_013740	TAC	2	6	213286	213291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047565
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4078	NC_013740	GGACC	2	10	213378	213387	20 %	0 %	40 %	40 %	284047565
4079	NC_013740	GGT	2	6	213402	213407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047565
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4088	NC_013740	CCAT	2	8	213839	213846	25 %	25 %	0 %	50 %	284047565
4089	NC_013740	TGG	2	6	213848	213853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047565
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4091	NC_013740	TGC	2	6	213878	213883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047565
4092	NC_013740	GGGATG	2	12	213887	213898	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	284047565
4093	NC_013740	TCA	2	6	213932	213937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047565
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4095	NC_013740	CCTGG	2	10	213990	213999	0 %	20 %	40 %	40 %	284047565
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4100	NC_013740	GGC	2	6	214221	214226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
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4103	NC_013740	TTC	2	6	214318	214323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047565
4104	NC_013740	CGG	2	6	214341	214346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
4105	NC_013740	GCA	2	6	214452	214457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047566
4106	NC_013740	CCTG	2	8	214577	214584	0 %	25 %	25 %	50 %	284047566
4107	NC_013740	GCT	2	6	214604	214609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047566
4108	NC_013740	TCA	3	9	214618	214626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047566
4109	NC_013740	ACC	2	6	214668	214673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047566
4110	NC_013740	GGCCT	2	10	214680	214689	0 %	20 %	40 %	40 %	284047566
4111	NC_013740	CGG	2	6	214718	214723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047566
4112	NC_013740	CTG	2	6	214725	214730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047566
4113	NC_013740	ATCT	2	8	214767	214774	25 %	50 %	0 %	25 %	284047566
4114	NC_013740	GAA	2	6	214791	214796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047566
4115	NC_013740	CAT	2	6	214808	214813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047566
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4118	NC_013740	TCA	2	6	214864	214869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047566
4119	NC_013740	CGT	2	6	214905	214910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047567
4120	NC_013740	AGA	3	9	214938	214946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047567
4121	NC_013740	AGC	2	6	214974	214979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047567
4122	NC_013740	GGAA	2	8	214997	215004	50 %	0 %	50 %	0 %	284047567
4123	NC_013740	CGGC	2	8	215081	215088	0 %	0 %	50 %	50 %	284047567
4124	NC_013740	ATC	2	6	215230	215235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047567
4125	NC_013740	TGG	2	6	215267	215272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047567
4126	NC_013740	CTG	2	6	215446	215451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047567
4127	NC_013740	GGA	2	6	215469	215474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047567
4128	NC_013740	GCCCA	2	10	215522	215531	20 %	0 %	20 %	60 %	284047568
4129	NC_013740	GCG	2	6	215596	215601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047568
4130	NC_013740	GGC	2	6	215626	215631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047568
4131	NC_013740	GCT	3	9	215638	215646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
4132	NC_013740	ATC	2	6	215711	215716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047568
4133	NC_013740	CTG	2	6	215789	215794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
4134	NC_013740	CTG	2	6	215822	215827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
4135	NC_013740	GCT	2	6	215836	215841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
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4138	NC_013740	CCT	2	6	215893	215898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047568
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4140	NC_013740	CTG	2	6	216014	216019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
4141	NC_013740	TGG	2	6	216180	216185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047568
4142	NC_013740	GA	3	6	216192	216197	50 %	0 %	50 %	0 %	284047568
4143	NC_013740	GAA	2	6	216215	216220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047568
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4146	NC_013740	CGGAAG	2	12	216435	216446	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	284047568
4147	NC_013740	GAT	2	6	216454	216459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047568
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4149	NC_013740	TGA	2	6	216584	216589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047569
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4151	NC_013740	CCG	2	6	216701	216706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047569
4152	NC_013740	GCTACC	2	12	216739	216750	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284047569
4153	NC_013740	CCG	2	6	216773	216778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047569
4154	NC_013740	AAGG	2	8	216856	216863	50 %	0 %	50 %	0 %	284047569
4155	NC_013740	TGA	2	6	217002	217007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047570
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4158	NC_013740	A	6	6	217148	217153	100 %	0 %	0 %	0 %	284047570
4159	NC_013740	G	6	6	217184	217189	0 %	0 %	100 %	0 %	284047570
4160	NC_013740	CGG	2	6	217263	217268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047570
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4165	NC_013740	GAA	2	6	217489	217494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047570
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4192	NC_013740	CAT	2	6	218947	218952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047571
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4209	NC_013740	AAG	2	6	219521	219526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047571
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4212	NC_013740	CTGAC	2	10	219588	219597	20 %	20 %	20 %	40 %	284047571
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4228	NC_013740	CCCGG	2	10	220285	220294	0 %	0 %	40 %	60 %	284047572
4229	NC_013740	TGA	2	6	220326	220331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047572
4230	NC_013740	CGG	2	6	220368	220373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047572
4231	NC_013740	ATG	2	6	220374	220379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047572
4232	NC_013740	ACC	2	6	220409	220414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047572
4233	NC_013740	CGG	2	6	220428	220433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047572
4234	NC_013740	ACC	2	6	220445	220450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047572
4235	NC_013740	TGCC	2	8	220451	220458	0 %	25 %	25 %	50 %	284047572
4236	NC_013740	CGG	2	6	220529	220534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047572
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4239	NC_013740	GCTG	2	8	220841	220848	0 %	25 %	50 %	25 %	284047573
4240	NC_013740	ATT	2	6	220849	220854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047573
4241	NC_013740	CAG	2	6	220872	220877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047573
4242	NC_013740	CGG	2	6	220948	220953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047573
4243	NC_013740	GAA	2	6	221067	221072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047573
4244	NC_013740	CCG	2	6	221075	221080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047573
4245	NC_013740	CAA	2	6	221105	221110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047573
4246	NC_013740	GGC	2	6	221146	221151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047573
4247	NC_013740	TGC	2	6	221167	221172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
4248	NC_013740	G	6	6	221260	221265	0 %	0 %	100 %	0 %	284047573
4249	NC_013740	TGG	2	6	221290	221295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047573
4250	NC_013740	CTG	3	9	221313	221321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
4251	NC_013740	CTG	2	6	221325	221330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
4252	NC_013740	CTG	2	6	221334	221339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
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4254	NC_013740	TGA	2	6	221470	221475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047573
4255	NC_013740	GGGC	2	8	221499	221506	0 %	0 %	75 %	25 %	284047573
4256	NC_013740	AAC	2	6	221526	221531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047573
4257	NC_013740	GAC	2	6	221574	221579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047573
4258	NC_013740	ATC	2	6	221649	221654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047573
4259	NC_013740	TGC	2	6	221680	221685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
4260	NC_013740	TGC	2	6	221710	221715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
4261	NC_013740	CTG	2	6	221724	221729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
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4268	NC_013740	GCT	2	6	221915	221920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
4269	NC_013740	CGG	2	6	221971	221976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047573
4270	NC_013740	CTG	2	6	222060	222065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
4271	NC_013740	GAG	2	6	222084	222089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047573
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4274	NC_013740	C	6	6	222315	222320	0 %	0 %	0 %	100 %	284047574
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4279	NC_013740	CAG	2	6	222695	222700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047574
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4293	NC_013740	TCCC	2	8	223258	223265	0 %	25 %	0 %	75 %	284047575
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4329	NC_013740	TTC	2	6	225784	225789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047578
4330	NC_013740	CTGG	2	8	225810	225817	0 %	25 %	50 %	25 %	284047578
4331	NC_013740	CCA	2	6	225822	225827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047578
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4333	NC_013740	A	7	7	226160	226166	100 %	0 %	0 %	0 %	284047579
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4338	NC_013740	CTGG	2	8	226788	226795	0 %	25 %	50 %	25 %	284047581
4339	NC_013740	GAA	2	6	226818	226823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047581
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4344	NC_013740	GATG	2	8	227019	227026	25 %	25 %	50 %	0 %	284047581
4345	NC_013740	CTG	2	6	227062	227067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047581
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4350	NC_013740	GAA	2	6	227341	227346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047581
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4353	NC_013740	G	6	6	227574	227579	0 %	0 %	100 %	0 %	284047582
4354	NC_013740	CGGCAG	2	12	227647	227658	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284047582
4355	NC_013740	GAA	2	6	227663	227668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047582
4356	NC_013740	TGC	2	6	227712	227717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047582
4357	NC_013740	TGCCC	2	10	227743	227752	0 %	20 %	20 %	60 %	284047582
4358	NC_013740	CTG	2	6	227855	227860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047582
4359	NC_013740	TGG	2	6	227940	227945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047582
4360	NC_013740	TGGCCC	2	12	227949	227960	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284047582
4361	NC_013740	GCC	2	6	227978	227983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047582
4362	NC_013740	AAGG	2	8	228032	228039	50 %	0 %	50 %	0 %	284047582
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4365	NC_013740	CTG	2	6	228143	228148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047582
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4370	NC_013740	TGC	2	6	228303	228308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047582
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4482	NC_013740	GAA	2	6	234156	234161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047585
4483	NC_013740	CTG	2	6	234183	234188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047585
4484	NC_013740	CGG	2	6	234256	234261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
4485	NC_013740	GGC	2	6	234276	234281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
4486	NC_013740	CGG	2	6	234301	234306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
4487	NC_013740	GAA	2	6	234356	234361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047585
4488	NC_013740	CGG	2	6	234491	234496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
4489	NC_013740	CAG	2	6	234584	234589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047585
4490	NC_013740	ATG	2	6	234657	234662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047585
4491	NC_013740	TGG	2	6	234697	234702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047585
4492	NC_013740	CTG	2	6	234714	234719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047585
4493	NC_013740	A	6	6	234741	234746	100 %	0 %	0 %	0 %	284047585
4494	NC_013740	GCA	2	6	234754	234759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047585
4495	NC_013740	ACA	2	6	234775	234780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047585
4496	NC_013740	CCTGTC	2	12	234803	234814	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	284047585
4497	NC_013740	CGG	2	6	234850	234855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
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4500	NC_013740	CGA	2	6	234908	234913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047585

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